بیمارستان فارابی در بهمن ماه سال 1356 تحت عنوان بیمارستان نهم آبان و با بخشهای روانپزشکی زنان و مردان فعالیت خود را آغاز نمود، پس از انقلاب نام بیمارستان از نهم آبان به فارابی تغییر یافت، سپس در سال 1358 بخشهای سل، ارولوژی، ارتوپدی و فک و صورت در یک دوران کوتاه به این مجموعه افزوده شد، و همزمان با آغاز جنگ تحمیلی قسمتی بنام بخش شهید رجایی جهت خدمت رسانی به مجروحان جنگی راهاندازی گردیده است. در سال 1370 بخشهای چشم پزشکی همراه با چهار اتاق عمل و درمانگاه تخصصی افتتاح شده و در سال 1386 اورژانس بیمارستان با همت خیرین محترم احداث و شروع به فعالیت نموده است. از سال 1393 همزمان با شروع طرح تحول سلامت اکثر بخشهای بیمارستان بازسازی شده و در سال 1394 این بیمارستان با هدف تبدیل شدن به یک بیمارستان مرجع با تغییر ماموریت به مجتمع تخصصی و فوق تخصصی فارابی تغییر نام داد. هم اکنون مجموعه چشم پزشکی این مجتمع با استفاده از پزشکان متخصص و فوق تخصص در کلیه رشتهها همچنین فضاهای مناسب نظیر درمانگاه تخصصی، دی کلینیک، اتاق عمل و با استفاده از تجهیزات پیشرفته و انجام تمامی عملهای تخصصی چشم به عنوان قطب دوم چشم پزشکی استان در کنار بیمارستان فیض در حال خدمترسانی به مردم استان می باشد.
بخشهای روانپزشکی و دو اورژانس روانپزشکی مجزای زنان و مردان و حضور 24 ساعته روانپزشک مقیم مشغول سرویسدهی است. ارتقاء و کیفیت فضای فیزیکی بخشها، باز کردن درب کلیه بخشهای روانپزشکی و حذف بخشهای در بسته، ارتقاء خدمات هتلینگ شامل تغذیه- بهداشت فردی- تسهیلات رفاهی- ارتقاء خدمات درمانهای غیر دارویی شامل برنامههای آموزشی خانواه درمانی – برنامههای بازگشت به اجتماع – ورزش- کاردرمانی- موسیقی درمانی به روشهای علمی – راهاندازی بخشهای VIP به منظور ایجاد تحصیلات ویژه برای قشری از جامعه که همیشه برای درمان بیماران خود سرگردان بودند به همراه خدمات ویژه رواندرمانی و هتلینگ ویژه شامل سرویس بهداشتی و حمام جداگانه، آشپزخانه با سرویس کامل، یخچال، تلویزیون، کاناپه، میز غذاخوری، چایساز از جمله شاخصهای مهم تحویل در بخشهای روانپزشکی طی سالهای اخیر است.
در حال حاضر این مجتمع دارای 6 بخش روانپزشکی زنان و مردان، بخشهای داخلی، جراحی، چشم، دیکلینیک، دیالیز، اورژانس روانزشکی مردان و زنان، اورژانس رفع آلودگی و اورژانس عمومی است. واحدهای پاراکلینیک شامل آزمایشگاه، بانک خون، رادیولوژی، سونوگرافی، سی تی اسکن، داروخانه و خدمات چشم پزشکی همچون شبکیه، قرنیه، استرابیسم، یوونیت و OCT، یگ لیزر، بیومتری، پریمتری و لیزر PRP است.